流體控制及自動化專業方向包括流體控制及自動化系和電液伺服仿真及試驗系統研究所。前身為1955年9月由蘇聯專家協助創建的水力機械專業，為國内創辦的第一個水力機械專業，為清華、上海交大和浙大等院校相關專業培養或輸送師資力量，是我國液壓與氣動專業的發源地。1980年獲得碩士學位授予權，1983年獲得博士學位授予權。一級學科機械工程及二級學科機械電子工程均為國家重點學科。本學科建成省級精品課程1門，校級優秀課程1門，雙語教學課程6門，出版教材及專著20餘部，為流體傳動及控制領域培養了大批優秀人才。近5年來，先後完成科研項目100餘項，其中國家自然科學基金項目15項，獲得國家科技進步獎二等獎2項，國防科技進步獎二等獎3項。發表高水平學術論文300餘篇，其中被SCI、EI檢索100餘篇。

目前共有師資32人，其中教授7人，博士生導師9人，副教授及高工15人，講師7人，分屬液壓基礎理論和控制系統研究室、氣動技術中心、液壓與氣動技術研究室、電液伺服及運動控制研究室四個研究室。主要從事流體控制及自動化專業本科和研究生教學工作以及流體力學基本理論、新型液壓元件、先進液壓傳動及控制技術、新型氣壓元件及氣壓控制技術和電液伺服仿真與實驗技術的科研工作。